| Titre : | Sélection de composés bioactifs avec un potentiel anti-inflammatoire grâce à la technique de docking moléculaire |
| Auteurs : | M SLIMANI, Directeur de thèse ; Imene Nour EL Houda MOUSSAOUI, Auteur |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Dr. Moulay Tahar Université Saida, Faculté des Sciences Naturelles et de la Vie, 2023/2024 |
| Format : | 87 p / 29 CM |
| Accompagnement : | CD |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | acide acetyl salicylique ; Anti-inflammatoires non stéroïdiens(AINS) ; apigénine ; celecoxib ; chrysine ; Cyclooxygénase-2 (COX-2) ; diclofenac ; Docking moléculaire ; Flavonoïdes ; gingerol ; galangin ; kaempférol,quercétine, resvératrol. |
| Résumé : |
La cyclooxygénase-2 (COX-2) est une enzyme clé impliquée dans le processus
inflammatoire. Son inhibition constitue une cible thérapeutique majeure pour le développement d'agents anti-inflammatoires. Les composés bioactifs d'origine végétale, en raison de leur diversité structurale et de leurs propriétés pharmacologiques potentielles, représentent une source prometteuse de nouveaux agents anti-inflammatoires. L’étude de docking moléculaire réalisée a permis d'explorer les interactions entre les composés bioactifs flavonoides et non flavonoides dont la curcumine ,Le resvératrol, La quercétine, Le kaempférol, l'apigénine, la chrysine, le gingerol, le galangin et la protéine COX-2 ( code 3LN1, co cristallisé avec le celecoxib, un inhibiteur spécifique de la COX-2, en les comparant avec des anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS) bien connus (Nimésulide, acide acétyl salicylique et diclofenac). Les scores de liaison, les RMSD et les interactions avec les résidus d'acides aminés du site actif de la COX-2 ont été analysés pour chaque composé bioactif. Cette étude nous permettra de mieux comprendre la capacité de ces composés à moduler l'activité de la COX-2 et à potentiellement inhiber l'inflammation. Les huit composés bioactifs testés présentent des modes d'interaction distincts avec la COX-2, impliquant des liaisons hydrogène et hydrophobes avec des acides aminés clés du site actif. Leur affinité de liaison varie, indiquant une diversité d'interactions. Ces composés bioactifs partagent certaines similitudes de liaison avec le célécoxib, mais présentent également des interactions uniques. Cela suggère un mode d'action plus complexe et étendu, potentiellement avec une meilleure sélectivité. Tous les composés partagent des motifs structuraux communs avec les AINS, tels que des groupes phénoliques, hydroxyles et méthoxy, qui sont impliqués dans les interactions avec les résidus d'acides aminés du site actif. Des études expérimentales approfondies sont nécessaires pour valider les résultats du docking moléculaire et évaluer l'efficacité anti-inflammatoire des composés bioactifs in vitro et in vivo . |
| Note de contenu : |
Introduction
PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE CHAPITRE 1 : REACTION INFLAMMATOIRE 5 1 Réaction inflammatoire 5 1.1 Physiologie de l’inflammation 6 1.2 Mécanisme de l’inflammation 6 1.2.1 Phase vasculo-exsudative 6 1.2.2Phase du granulome inflammatoire 6 1.2.3 Phase de détersion 7 1.2.4 Phase de cicatrisation 8 1.3 Médiateurs inflammatoires 10 2 La cyclooxygénase 11 2.1 Caractéristique et différence entre les iso-enzymes de la COX 12 2.1.1 Isoformes de la cyclooxygénase 12 Isoforme COX-1 13 Isoforme COX-2 15 2.2 Structure 3D de la COX-2 16 3 Inhibition de l’inflammation 16 3.1 Les anti-inflammatoire non-stéroïdiens 17 3.1.1 Sélectivité des inhibiteurs de la COX 17 Les inhibiteurs non sélectifs 18 Les inhibiteurs sélectifs COX-2 19 Caractéristiques structurales des COXIBS Chapitre 2 : ACTIVITE ANTI-INFLAMMATOIRE DES SUBSTANCE BIOACTIVE D’ORIGINE VEGETAL 22 1 Substance phénolique 22 1.1 Classification des Polyphénols 22 1.1.1 les acides phénoliques 22 L’acide hydroxycinnamique 22 L’acide hydroxybenzoïque 23 1.1.2 Les flavonoïdes 23 Structure chimique 24 Classification des flavonoïdes 25 1.1.3 Les tannins 25 les tanins hydrolysables 25 les tanins condensés 26 1.2 Activité anti-inflammatoire des composés phénoliques VICHAPITRE 3 : DOCKING MOLECULAIRE 1 Docking moléculaire 1.1 Principe de docking 1.2 Type de docking 1.3 Etapes de docking 1.3.1 Etape de docking 1.3.2 Etape de scoring Les fonctions de scoring empiriques Les fonctions basées sur la connaissance Les fonctions de score basées sur les champs de force 1.4 Type d’interaction 1.4.1Liaison hydrogène 1.4.2 Liaison hydrophobe 1.4.3 Interactions de Van der Waals 1.4.4 Interaction électrostatique 1.4.5 Interaction métal-ligand 1.4.6 Interaction aromatique impliquent des systèmes π 1.5 Energie libre de liaison 1.6 Root mean square deviation (RMSD) 1.7 Choix des composés à tester PARTIE PRATIQUE CHAPITRE 04 : MATERIELS ET METHODES 1 Préparation des structures 1.1 Préparation de l'enzyme COX-2 1.2Préparation des composés bioactifs 2 Docking moléculaire 3 Analyse des résultats de docking 4 Visualisation des interactions RESULTATS DISSCUSSION CONCLUSION VII |
Exemplaires
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
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| aucun exemplaire |
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