| Titre : | Évaluation de l'efficacité antifongique des isolats de Bacillus sp. et d'Actinomycètes dans la lutte contre certaines espèces fongiques pathogènes affectant les cultures de tomates |
| Auteurs : | : Belkadi Safia, Auteur ; Djebbar Hanane, Auteur ; HALLA Noureddine, Directeur de thèse |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Dr. Moulay Tahar Université Saida, Faculté des Sciences Naturelles et de la Vie, 2023/2024 |
| Format : | 90 p / 29 CM |
| Accompagnement : | CD |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Catégories : | |
| Mots-clés: | rhizosphère ; antifongique ; bio-stimulants ; champignons pathogènes ; biocontrôle ; Bacillus ; Actinomycètes ; tomate. |
| Résumé : |
Cette étude a évalué le potentiel des isolats bactériens de la rhizosphère, appartenant aux genres Bacillus et Actinomycètes, en tant qu'agents de biocontrôle contre quatre champignons pathogènes majeurs : Aspergillus niger, Aspergillus flavus, Penicillium notatum et Fusarium oxysporum. Parmi les sept souches testées, B6 a montré une activité antifongique remarquable, avec des zones d'inhibition atteignant 60 mm contre A. flavus et P. notatum. Les concentrations minimales fongicides (CMI) pour B6 variaient de 2 à 8 mg/ml. Les expériences in vivo sur des plants de tomate ont confirmé que les souches B6, B2, Aa, et G réduisaient significativement les symptômes causés par F. oxysporum et A. flavus. Un test statistique de comparaison des moyennes a révélé que ces souches ont contribué de manière très hautement significative à l'augmentation du taux de croissance des plantes par rapport au témoin (T). Ces bactéries ont également stimulé la phytomasse aérienne des plants. Les tests d'inoculation foliaire ont montré une réduction marquée des symptômes fongiques grâce aux suspensions bactériennes, confirmant leur double effet comme biostimulants et agents de biocontrôle. Ces résultats soulignent le potentiel biotechnologique des isolats de Bacillus et d'Actinomycètes pour développer des stratégies de lutte biologique durable contre les maladies des cultures de tomates.
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| Note de contenu : |
Introduction générale1
Chapitre I : Généralités sur la tomate I.1.Importans de tomate ……………………………………………………….…..…..…06 I.2.Composition de la tomate fraiche …………………………………………………..…06 I.3. Exigences édapho-climatiques de la tomate…………………......................................06 I.3 .1 .Température………………………….. ………………………………...06 I.3.2 .Humidité…………………………………………………………………07 I.3.3. Lumière………………………………………………….........................07 I.3.4. Le sol ……………………………………………………………………07 I.3.5 .Le pH:…………………………………………………………………...07 I.3.6.Salinité…………………………………………………………………....07 I.3.7.Eau…………………………………………..……………..………….….08 I.4. Les types de tomates …………………………………………………….…..……….08 I.4.1. Tomate de table ……………………………………………………….………...…08 I.4.2 .Tomate industrielle …………………………………………………………………08 I.5 .Importance économique de tomate………………………………………….…..….....09 I.5.1. Au niveau mondial…………………………………………………………..………09 I.5.2 .Tomate en Algérie……………………………………………………………...……09 I.6. Classification de la tomate……………………………………………………….…....10Table des matières II.6.1. Classification botanique………………………………………………………….....10 I.7.Les contraintes de la culture de la tomate …………………….………………….…...11 I.7.1. Les contraintes abiotiques…………………………………………………………...11 I.7.2.Les contraintes biotiques……………………………………………………….….....12 Chapitre II : Les Maladies De La Tomate II.1 Introduction sur les maladies des plants……………………………………………. 15 II.2. Les classification de maladies………………………………………………………..15 II.2.1 Les maladies non infectieuses………………………………………………………15 II.2.2 Les maladies infectieuses…………………………………………...………………15 I.3 Cycle infectieux d’un agent pathogène………………………………………………..16 I.4 Principales maladies de la tomate:……………………………………………………..16 I.4.1 Maladies cryptogamiques……………………………………………………………16 II.4.2Maladies bactériennes……………………………………………………………….20 II.4.3Les maladies virales:…………………………………………………………………22 Chapitre III: Les Moyens De Lutte Contre Les Maladies Des Plantes III.1 Les moyens de lutte contre les maladies des plantes……………………………..…26 III.1.1 Lutte curative…………………………………………………………………..….26 III.1.1.2 La lutte biologique……………………………………………………………....26 III.1.1.3 Les avantages et les inconvénients de la lutte biologique…………………………..29 III.2.1 Définition de PGPR………………………………………….…….…... ………….29 III.2.2 Les trois caractéristiques ………………………………………………….………30 III.2.3 Rôle de PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobactéria)…………… ………..….30 III.3 Mécanismes d’action des bactéries impliquées dans la lutte biologique…………...31Table des matières Chapitre IV: Matériels Et Méthodes Matériels et méthode………………………………………………………….......... 35 IV. Objectif……………………………………………………………………......36 IV.2Les souches bactériennes utilisées………………………………………………..…..37 IV.2.1 Les caractéristiques des souches ……………………………..…………………..37 IV.3 L’étude des souches microbiennes…………………………………………….……38 IV.3.1 Revivification des souches …………………………………………….………..38 IV.3.2 Les germes cibles.……………………………………………………………….38 IV.3.3 .Repiquage des souches fongique…………………………………………….…39 IV.3.4 La Coloration et l'observation microscopique des souche……………………39 IV.3.5 La Conservation des souches bactériennes……………………………….39 IV.4 Évaluation du potentiel antifongique………………………………………….39 IV.4.1 Activité antifongique ……………………………………………………….39 IV.4.2 Fermentation sur milieu liquide …………………………………………40 IV .2.3. L’extraction……………………………………………………….………40 IV.2.4. Tests de l’activité antifongique des l'extraits CMI ....................................40 IV .3. Les Tests In Vivo……………………………………………………..……41 IV3.1. La préparation de Mcfarland……………………………………………....41 IV .3.2. Inoculation des feuilles………………………………………………...…41 IV 3.3. Evaluation de l'effet antagoniste in vivo…………………………………42 IV .3.4. Analyse statistique……………………………………………………..…44 Chapitre IV : Résultat et discussion V. Résultat et discussion ………………………………………………………….46 V.1Revivification des souches bactériale :……………………………………..….46 V.1.1.Aspect macroscopique………………………………..….…………..……..46 V.1.1.2 .Aspect microscopique…………………………………………….……...48 V. 2 Résultats des critères morphologiques des souches fongiques……...……….49 V. 2 .1.Aspects macroscopiques……………………………………………….….49 V. 2 .1.1.Aspergillus niger……………………………………………………….49 V. 2 .1.2 Fusariumoxysporum.……………….…………………………………………49Table des matières V. 2 .1.3Aspergillus flavus ………………………………………………….…….…….50 V. 2 .1.4Penicillium notatum…………………………………………………………….……....50 V. 3 Aspects microscopique.…………………………………………………….….……51 V. 3.1 Aspergillusniger………………………………………………………….….…………...51 V. 3.2 Fusarium oxysporum………………………………………………….….…………........51 V. 3.3 Aspergillus flavus………………………………………………………….……..52 V. 3.4 Penicillium notatum………………………………………………………………….…….52 V.3. Mise en évidence de l’activité antifongique des souches………………………..…53 V.3.1.Actinomycètes ……………………………………………………………………….……....53 V.3.2.Bacillus……………………..……………………………………………………..……..…..56 V. 4. Calcul des concentrations de suspensions bactériennes ………………………… ..59 V. 5. Test antifongique de l'extrait brut des souches B6 et B2 et Aa……................……..60 V. 6. Résultats de l’antagonisme in vivo ……………………………………………...…66 V. 6.1.Stimulation de la croissance des plantes :………………………………………….66 V. 7. les résultats de l'inoculation des feuilles :…………………………..……… …...…70 V. 7.1 Test de comparaison de moyennes:……..………………………………….…........72 VI. Conclusion :………………………………………………………………………….. 77 VII. Référence bibliographique :…………………………………………………………. 80 VIII. Annexe :…………………………………………………………………………..…90 |
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