| Titre : | Contribution à l’étude de l’effet préventif des huiles essentielles du Thymus vulgaris contre la formation de biofilms chez Candida albicans |
| Auteurs : | DADDI Soumaya, Auteur ; HAMDI Zoubida, Auteur ; HALLA Noureddine, Directeur de thèse |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Dr. Moulay Tahar Université Saida, Faculté des Sciences Naturelles et de la Vie, 2015/2016 |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Catégories : | |
| Mots-clés: | Candida albicans ; cathéters ; biofilms ; fluconazole ; huiles essentielles ; Thymus vulgaris. |
| Résumé : |
Le domaine de l’infectiologie a été bouleversé au cours des 25 dernières années par
l’augmentation considérable du nombre d’infections contractées à l’hôpital (infections nosocomiales). Ces dernières, sont liées essentiellement aux dispositifs médicaux tels que les cathéters et les sondes urinaires qui favorisent la formation des biofilms. Dans ce contexte nous avons entrepris cette étude au niveau de l’hôpital HAMDEN BAKHTA de Saida, qui consiste à isoler des souches de Candida albicans à partir de cathéters directement après leurs excisions des patients et de vérifier, d’une part, leur pouvoir à former des biofilms, d’autre part, de tester leur résistance vis-à-vis de fluconazole, l’antifongique le plus utilisé en milieu clinique et l’huile essentielle de Thymus vulgaris. Sur 34 prélèvements, 6 souches de Candida albicans ont été isolées. Il ressort de cette étude que les tests antifongiques de l’huile essentielle de Thymus vulgaris à un effet inhibitrice vis- à-vis les cellules sessiles à une concentration entre 0.19 et 0.39 mg/ml, mais les cellules planctoniques sont résistantes à cette concentration, et concernant le fluconazole, C. albicans b est résistante au cette antifongique par contre C. albicans ATCC 10231 est sensible |
| Note de contenu : |
Introduction générale …………………………………………………………………1
PARTIE I : synthèse bibliographique ………………………………………………… 3 Chapitre I: Généralités sur Candida albicans…………………………………………. 4 1. Introduction. …………………………………………………………………………. 2. Définition………………………………………………………………………………………. 3. Morphologie……………………………………………………………………………………. 3.1. La première forme …………………………………………………………....................... 3.2. La deuxième forme ………………………………………………………………………… 3.3 La troisième forme ………………………………………………………………………….. 4. Croissance ……………………………………………………………………………………... 5. Les constituants cellulaires de C .albicans ………………………………………………... 5.1. La paroi …………………………………………………………………………………….... 5.2. Les manno protéines ……………………………………………………………………….. 5.3. Les Glucanes ………………………………………………………………………………. 5.4. La chitine …………………………………………………………………………………… 6. Le quorum sensing …………………………………………………………………………… 7. Génome ………………………………………………………………………………………… 8. Les Candidoses ……………………………………………………………………………… 8.1. Les candidoses superficielles ……………………………………………………………. A. Les candidoses digestives …………………………………………………………………… 1. La candidose orale ……………………………………………………………………………. 2. La candidose au niveau de la muqueuse oesophagienne ………………………………… 3. La candidose au niveau de la muqueuse gastro-intestinale ……………………………... B. La candidose orale et VIH ………………………………………………………………….. C. Les candidoses uro-génitales ……………………………………………………………….. D. Les candidoses cutanées et unguéales …………………………………………………….. 1. l’intertrigo des grands plis …………………………………………………………………… 2. l’intertrigo des petits plis …………………………………………………………………….. E. Les candidoses cutanéo-muqueuses chroniques …………………………………………. 8.2. Les candidoses profondes …………………………………………………………………. Chapitre II : Les biofilms fongiques …………………………………………………. 1. Généralité ……………………………………………………………………………………… 202. Le biofilm de C. albicans ……………………………………………………………………. 3. Structure des biofilms ……………………………………………………………………….. 4. Formation du biofilm de Candida albicans ……………………………………………….. 5. La résistance des biofilms aux antifongiques ……………………………………………... Chapitre III : La plante étudiée Thymus vulgaris …………………………………… 1. Généralités …………………………………………………………………………………….. . 2. Description botanique de la plante …………………………………………………………. 2.1. Tige …………………………………………………………………………………………... 2.2. Feuilles ……………………………………………………………………………………… 2.3. Racines ………………………………………………………………………………………. 3. Classification botanique de Thymus vulgaris …………………………………………...20 4. Les huiles essentielles ……………………………………………………………………….. 5. Composition chimique ……………………………………………………………………….. 6. Effets antimicrobiens ……………………………………………………………………….. Partie expérimentale …………………………………………………………………… PARTIE II : Matériel et Méthodes …………………………………………………... I. Extraction des huiles essentielles …………………………………………………… I.1Matériel végétale ……………………………………………………………………. I.2. Procédure d’extraction des huiles essentielles……………………………………… I.3Décantation …………………………………………………………………………... II. Prélèvements, isolement et identification de Candida albicans ……………………….. II.1Prélèvements ………………………………………………………………………... II.2Isolement et purification …………………………………………………………… II.3 Identification ……………………………………………………………………….. II.3.1Examen macroscopique ………………………………………………………….. II.3.2Examen microscopique …………………………………………………………... II.3.3Test de blastèse …………………………………………………………………… II.3.4Microculture sur le milieu PCB …………………………………………………... III. Evaluation du potentiel à former les biofilms des souches étudiées………………...31 III.1.Détermination des CMI et SCMI ………………………………………………… 42 III.1.1.Détermination des CMI …………………………………………………………. III.1.1.1Détermination des CMI du l’antifongique huile essentielle de thymus vulgaris.. III.1.1.1.1. Préparation des solutions des huiles essentielles …………………………… III.1.1.1.2.Préparation de l’inoculum …………………………………………………... a. Préparation de pré-culture …………………………………………………………………. b. Préparation de la suspension ……………………………………………………………… II.1.1.1.3. Utilisation de la microplaque (la méthode des micro-dilutions sur milieu liquide)……………………………………………………………………………….......42 III.1.1.1.4.Détermination de la concentration minimale fongicide (CMF) ……………..44 III.1.1.Détermination des SCMI ………………………………………………………... a.Préparation des souches ……………………………………………………………….44 45 43b.Formation des biofilms ……………………………………………………………….. c.Test antifongique ……………………………………………………………………... c.1.Antifongique fluconazole …………………………………………………………... c.2Antifongique huile essentielle Thymus vulgaris ……………………………………….. PARTIE III : Résultats et discussion …………………………………………………45 I. Extraction des huiles essentielles ……………………………………………………………50 I.1. Caractéristiques des huiles essentielles……………………………………………... I.2. Rendement en huile essentielle ……………………………………………………………50 50 II. Prélèvements, isolement et identification de Candida albicans ………………………..50 II.1. Choix de la souche …………………………………………………………………………50 II.2. Choix de prélèvement …………………………………………………………………….. II.3. Résultats de prélèvement ………………………………………………………………….51 51 II.1 Examen macroscopique de la souche ……………………………………………………. II.2 Examen microscopique ……………………………………………………………………. III. Détermination des CMI du l’antifongique huile essentielle de thymus vulgaris …… III.1.Détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI) et des concentrations minimales fongicides (CMF) …………………………………………... III.2. Etude de l’effet antifongique des huiles essentielles de Thymus vulgaris ……… IV. Evaluation du potentiel à former les biofilms des souches étudiées ……………... IV.1. Détermination des SCMI ………………………………………………………..53 IV.2Détermination des SCMI du l’antifongique huile essentielle de thymus vulgaris Conclusion générale ……………………………………………………. …………… Références bibliographiques ………………………………………………………… Annexe …………………………………………………………………………………63 |
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