| Titre : | Analyse du potentiel anti-inflammatoire de composés flavonoïdes par docking moléculaire : Identification des interactions avec les cibles biologiques |
| Auteurs : | Fellah Kada, Auteur ; Mankour Abdelkader, Auteur ; M SLIMANI, Directeur de thèse |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Dr. Moulay Tahar Université Saida, Faculté des Sciences Naturelles et de la Vie, 2024/2025 |
| Format : | 90 p / 29 CM |
| Accompagnement : | CD |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Catégories : | |
| Mots-clés: | 5IKR ; Acide méfénamique ; Anti-inflammatoire ; Apigénine ; Chrysine ; Cyclooxygénase-2 (COX-2 ; Docking moléculaire ; Fisétin ; Flavonoïdes ; Galangine ; Kaempférol ; Lutéoline ; Myricétine ; Naringénine ; Quercétine |
| Résumé : |
Le docking moléculaire, une méthode computationnelle importante en découverte de
médicaments pour prédire l'affinité et le mode de liaison des molécules, a été appliqué dans notre étude afin d'évaluer le potentiel inhibiteur d'une série de neuf flavonoïdes naturels sur la cyclooxygénase-2 (COX-2), une cible thérapeutique clé de l'inflammation. L'objectif principal était d'identifier des composés d'origine naturelle susceptibles d'offrir une alternative plus sûre aux AINS classiques. Nos résultats ont révélé que plusieurs flavonoïdes, en particulier la myricétine, la quercétine et la fisétine, présentent une affinité de liaison modérée à prometteuse pour la COX-2, avec des scores d'interaction comparables à celui de l'acide méfénamique. L'analyse du mode de liaison a montré que, contrairement à l'acide méfénamique qui interagit directement avec les résidus catalytiques TYR385 et SER530, les flavonoïdes privilégient des interactions avec des résidus périphériques tels qu'ARG44, GLN42 et GLU465, suggérant un mécanisme d'inhibition potentiellement non compétitif. L'analyse préliminaire des relations structure-activité (RSA) indique que la présence d'un nombre élevé de groupements hydroxyle sur le noyau flavonoïde, ainsi que leur positionnement stratégique pour former des liaisons hydrogène avec des résidus clés du site de liaison, semble favoriser une meilleure affinité pour la COX-2. Ces observations suggèrent que des modifications structurales ciblant l'augmentation du nombre de groupes hydroxyle et leur positionnement pourraient conduire à des inhibiteurs plus puissants. Cette étude in silico ouvre des perspectives pour la poursuite des recherches sur le potentiel thérapeutique des flavonoïdes comme inhibiteurs de la COX-2 et de leurs caractéristiques structurales dans la détermination de leur affinité |
| Note de contenu : |
INTRODUCTION1
1PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE3 1.1 ENZYME COX-2 ET SON ROLE DANS L'INFLAMMATION3 1.1.1 INTRODUCTION À L’INFLAMMATION3 1.1.2 LES CAUSES DE L’INFLAMMATION3 1.1.3 LES TYPES DE L’INFLAMMATION4 1.1.4 LES MÉDIATEURS DE L’INFLAMMATION5 1.1.5 LES MARQUEURS DE L’INFLAMMATION9 1.1.6 ROLE DE LA CYCLOOXYGENASE-2 (COX-2) DANS L’INFLAMMATION10 1.2 STRUCTURE ET FONCTION DE COX-211 1.2.1 DIFFERENCES ENTRE COX-1 ET COX-2 : COMPARAISON STRUCTURALE11 1.2.2ROLES PHYSIOLOGIQUES ET IMPLICATIONS PATHOLOG13 1.2.3 CARACTERISTIQUES FONCTIONNELLES DES ISOENZYMES : COX1 ET COX 2 1.3 ANTI-INFLAMMATOIRES NON STEROÏDIENS 1.3.1CLASSIFICATION DES AINS16 1.3.2 LES AINS NON SELECTIFS18 1.3.3 LES AINS SELECTIFS COX-2 (COXIBS)19 1.4 FLAVONOÏDES ET LEUR POTENTIEL ANTI-INFLAMMATOIRE 1.4.1 CLASSIFICATION DES FLAVONOÏDES21 1.4.2 SOUS-CLASSES PRINCIPALES DE FLAVONOÏDES22 1.4.3 BIOSYNTHÈSE DES FLAVONOÏDES28 1.4.4 MECANISMES ANTI-INFLAMMATOIRES DES FLAVONOÏDES311.5 LE DOCKING MOLECULAIRE 1.5.1 LES ETAPES DU DOCKING MOLECULAIRE33 1.5.2 LES FONCTIONS DE SCORING35 1.5.3 NATURE DES FORCES INTERACTIONS36 1.5.4 ENERGIE LIBRE DE LIAISON40 1.5.5 LES LOGICIELS DE DOCKING41 2 MATERIEL ET METHODES 2.1 CHOIX DU MODELE PROTEIQUE POUR LE DOCKING MOLECULAIRE42 2.2 LIGANDS CO-CRISTALLISES44 2.3 DOCKING MOLÉCULAIRE AVEC MOE (MOLECULAR OPERATING45 ENVIRONMENT) 2.4 LES ETAPES DU DOCKING MOLECULAIRE 3 RÉSULTATS ET DISCUSSION 3.1 STRUCTURE DE LA CYCLOOXYGENASE-2 (COX-2) HUMAINE (PDB ID 5IKR)63 3.2 DIAGRAMME DE RAMACHANDRAN DE LA 5IKR (CHAINE A) : ANALYSE66 CONFORMATIONNELLE 3.3 CARTOGRAPHIE DU SITE DE LIAISON DE L’ACIDE MEFANAMIQUE DANS LA 5IKR. 3.4 ANALYSE DES INTERACTIONS ENTRE L’ACIDE MEFANAMIQUE (LIGAND CO-CRISTALLISE) ET LA CHAINE A DE LA COX-2 (PDB : 5IKR) 3.5 ANALYSE DES INTERACTIONS DES FLAVONOÏDES AVEC LA CHAINE A DE LA COX-2 (PDB : 5IKR) 3.6 DISCUSSION GENERALE88 CONCLUSION90 |
Exemplaires
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
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| aucun exemplaire |
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