Titre : | Étude du potentiel antimicrobien des actinomycètes isolés des biotopes semi-arides de la région de Saida, Algérie |
Auteurs : | GUENNOUN Kheira, Auteur ; DJEMAA Refka Rekia, Auteur ; BENABBOU Taha Ahmed, Directeur de thèse |
Type de document : | texte imprimé |
Editeur : | Dr. Moulay Tahar Université Saida, Faculté des Sciences Naturelles et de la Vie, 2024/2025 |
Format : | 71 p / 29 CM |
Accompagnement : | CD |
Langues: | Français |
Langues originales: | Français |
Catégories : | |
Mots-clés: | Actinomycètes ; Streptomyces ; activité antimicrobienne ; activité antifongique ; antibiotiques ; métabolites secondaires ; sols arides ; Saïda (Algérie) |
Résumé : |
Dans le contexte de la résistance croissante aux antimicrobiens, les actinomycètes des
sols arides constituent une source précieuse de nouveaux composés bioactifs. L'objectif de cette étude est d'isoler et de caractériser des souches d'actinomycètes issues de sols de l'écosystème semi-aride de la région de Saïda (Ouest algérien), puis d'évaluer leur potentiel à produire des substances antimicrobiennes. Au total, dix souches d’actinomycètes ont été isolées à partir de deux échantillons de sol prélevés dans la localité de Sidi Merzouk. Suite à un criblage antimicrobien, sept isolats ont été sélectionnés pour leur activité inhibitrice prononcée. Ces sept isolats ont fait l'objet d'une caractérisation phénotypique préliminaire et leur spectre d'activité a été déterminé vis-à-vis d'un panel de micro-organismes pathogènes et d'altération : les bactéries à Gram-positif (Staphylococcus aureus ATCC 6538, Bacillus subtilis ATCC 6633, Bacillus cereus ATCC 25921), les bactéries à Gram-négatif (Escherichia coli ATCC 8739, Klebsiella pneumoniae) et les champignons (Aspergillus niger, Candida albicans, Penicillium sp.). L’activité antagoniste a été évaluée par la méthode de diffusion en milieu gélosé (technique des puits). Les résultats ont permis de sélectionner sept souches particulièrement actives, désignées RSK01, RDK02, RDK04, RSK05, RSK08, RDK09 et RSK10. Cette étude confirme que les sols inexplorés de la région semi-aride de Saïda constituent un réservoir précieux pour l'isolement d'actinomycètes producteurs de métabolites secondaires bioactifs, offrant ainsi des perspectives intéressantes pour la recherche de nouveaux antibiotiques. |
Note de contenu : |
PARTIE I. INTRODUCTION............................................................................................ 1
PARTIE II. SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE .............................................................. 4 II.1. GENERALITES SUR LES ACTINOMYCETES ..................................................................... 5 II.1.1. DEFINITION .................................................................................................................. 5 II.1.2. L’HABITAT ................................................................................................................... 5 II.2. CARACTERES MORPHOLOGIQUES : .............................................................................. 6 II.2.1. LES MYCELIUMS : ......................................................................................................... 8 II.2.2. FORMATION DES SPORES : ............................................................................................ 9 II.3. MATERIEL GENETIQUE DES ACTINOBACTERIES : ...................................................... 10 II.4. PHYSIOLOGIE DU DEVELOPPEMENT : ......................................................................... 10 II.5. CYCLE DE DEVELOPPEMENT DES ACTINOMYCETES : ................................................ 12 II.6. CLASSIFICATION DES ACTINOBACTERIES : ................................................................ 14 II.7. / TAXONOMIE ET IDENTIFICATION : ........................................................................... 16 II.7.1. LES CRITERES MORPHOLOGIQUES :............................................................................. 17 II.7.2. CRITERES CHIMIO TAXONOMIQUE : ............................................................................ 17 II.7.3. CRITERES PHYSIOLOGIQUES : ..................................................................................... 18 II.7.4. CRITERES MOLECULAIRES :........................................................................................ 19 II.8. IMPORTANCE DES ACTINOMYCETES :......................................................................... 20 II.9. LES MOLECULES BIOACTIVES PRODUITE PAR LES ACTINOMYCETES : ...................... 20 II.9.1. LE METABOLISME DES ACTINOMYCETES : .................................................................. 20 II.9.1.1. Le métabolisme primaire : ..................................................................................... 21 II.9.1.2. Le métabolisme secondaire :.................................................................................. 22 II.9.2. LES ANTIBIOTIQUES : ................................................................................................. 22Table des matières II.9.2.1. Définition : ............................................................................................................. 22 II.9.2.2. Origine des antibiotiques : ..................................................................................... 22 II.9.2.3. Les antibiotiques produits par les actinomycètes : ................................................ 23 II.9.2.4. Classification des antibiotiques : ........................................................................... 24 II.9.2.5. Mécanismes d’action des antibiotiques : ............................................................... 29 II.9.2.6. Résistance aux antibiotiques : ................................................................................ 31 II.9.2.6.1. Types de résistance ............................................................................................. 31 II.9.2.6.1.1. Résistance naturelle ......................................................................................... 31 II.9.2.6.1.2. Résistance acquise ........................................................................................... 31 II.9.3. LES ANTIFONGIQUES :................................................................................................ 32 II.9.3.1. Historique :............................................................................................................. 32 II.9.3.2. L’origine des substances antifongique ................................................................... 33 II.9.3.3. Classification des antifongiques ............................................................................ 33 II.9.3.4. Mode d’action des antifongiques ........................................................................... 33 II.9.3.5. Mécanisme de résistance des substances antifongique .......................................... 34 II.9.3.6. Les antifongiques produits par les actinomycètes ................................................. 36 PARTIE III. MATERIEL ET METHODES .................................................................... 37 III.1. MATERIEL.................................................................................................................. 38 III.1.1. MATERIEL BIOLOGIQUE : .......................................................................................... 38 III.1.2. APPAREILLAGE ET VERRERIE DE LABORATOIRE ........................................................ 38 III.1.3. MILIEUX DE CULTURE ET REACTIFS CHIMIQUES ........................................................ 38 III.2. METHODES : .............................................................................................................. 39 III.2.1. ÉCHANTILLONNAGE.................................................................................................. 39 III.2.2. PRETRAITEMENT DES ECHANTILLONS DE SOL ........................................................... 40 III.2.3. ISOLEMENT DES ACTINOMYCETES PAR LA METHODE DES DILUTIONS EN SERIE.......... 40 III.2.4. PURIFICATION :......................................................................................................... 41 III.2.5. CONSERVATION DES SOUCHES PURES :...................................................................... 41 III.2.6. IDENTIFICATION PHENOTYPIQUE DES ISOLATS .......................................................... 41 III.2.6.1. Caractères macroscopiques : ................................................................................ 42 III.2.6.2. Caractères microscopiques : ................................................................................. 42 III.2.7. CRIBLAGE DE L'ACTIVITE ANTIMICROBIENNE DES ISOLATS ....................................... 43 III.2.7.1. Préparation des inoculums des souches cibles ..................................................... 43Table des matières III.2.7.2. Criblage primaire par la méthode des cylindres d'agar (Plug Test) :.................... 43 III.2.7.3. Criblage secondaire par la méthode de diffusion en puits .................................... 44 PARTIE IV. RESULTATS ET DISCUSSION ................................................................. 46 IV.1. ISOLEMENT ET PURIFICATION DES SOUCHES D 'ACTINOMYCETES............................ 47 IV.2. CARACTERISATION PHENOTYPIQUE DES ISOLATS .................................................... 47 IV.2.1. CARACTERES MACROSCOPIQUES .............................................................................. 48 IV.2.2. CARACTERES MICROSCOPIQUES................................................................................ 48 IV.3. RECHERCHE DE L’ACTIVITE ANTIMICROBIENNE DES ISOLATS : .............................. 51 IV.3.1. CRIBLAGE PRIMAIRE DE L'ACTIVITE ANTIBACTERIENNE PAR LA METHODE DES CYLINDRES D 'AGAR :............................................................................................................. 51 IV.3.2. CRIBLAGE SECONDAIRE DE L'ACTIVITE ANTIBACTERIENNE PAR LA METHODE DE DIFFUSION EN PUITS .............................................................................................................. 53 IV.3.3. ACTIVITE ANTIFONGIQUE DES EXTRAITS BRUTS........................................................ 56 IV.3.4. ANALYSE COMPAREE ET IMPLICATIONS DES PROFILS D'ACTIVITE DES ISOLATS RDK09 ET RSK10 ............................................................................................................................. 58 PARTIE V. CONCLUSION ET PERSPECTIVES ......................................................... 61 PARTIE VI. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES ................................................... 64 PARTIE VII. ANNEXE .................................................................................................... 71 |
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