| Titre : | In silico characterization of pathogenicity-related genes in Phytophthora cinnamomi |
| Auteurs : | Aya Dellas, Auteur ; Mokhtar Benreguieg, Directeur de thèse ; Altino Branco Choupina, Directeur de thèse |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Dr. Moulay Tahar Université Saida, Faculté des Sciences Naturelles et de la Vie, 2025/2026 |
| Format : | 56 p / 29 CM |
| Accompagnement : | CD |
| Langues: | Anglais |
| Langues originales: | Anglais |
| Catégories : | |
| Mots-clés: | Phytophthora cinnamomi ; oomicetes ; Castanea sativa ; Poligalacturonase ; CRN ; RXLR ; ferramentas bioinformáticas ; SignalP 6.0 |
| Résumé : |
Phytophthora cinnamomi é um oomicete altamente destrutivo de solo e um dos
patógenos de plantas mais invasivos do mundo. Com uma gama de hospedeiros superior a 5.000 espécies, causa grave podridão radicular e declínio, particularmente em Castanea sativa, resultando em perdas significativas na silvicultura e horticultura. A sua ampla adaptabilidade ambiental torna-o uma ameaça extensiva à saúde das plantas e difícil de gerir. Este estudo teve como objetivo caracterizar os fatores moleculares envolvidos na patogenicidade de P. cinnamomi, identificando genes e efetores relacionados à patogenicidade molecular e analisando seus domínios, localização subcelular e estrutura 3D. Utilizando ferramentas bioinformáticas, o trabalho identificou e caracterizou os efetores candidatos de RXLR, CRN e Poligalacturonase no genoma de P. cinnamomi. Neste estudo, a estrutura 3D da Poligalacturonase foi modelada com sucesso, com alta confiança e identidade de sequência com a Poligalacturonase I de Aspergillus niger e Endo-poligalacturonase de Phytophthora nicotianae. Estes resultados apoiam a sua classificação dentro Glicosil Hidrolases da família 28 (GH28), caracterizada por uma estrutura em hélice-β. Além disso, identificamos uma sequência do efetor RXLR de 289 aminoácidos com 72.43% de identidade com a proteína Avh240 RXLR de Phytophthora sojae. Além disso, a análise com SignalP 6.0 indicou a ausência de um péptido de sinal clássico no efetor CRN de P. cinnamomi, sugerindo o possível envolvimento de vias alternativas de secreção ou translocação. |
Exemplaires
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
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